Genómica y Secuenciación

Secuenciador automático de 8 capilares que permite llevar a cabo aplicaciones basadas en electroforesis capilar.

La plataforma incluye el siguiente equipamiento y software:

• Applied Biosystems 3500 Genetic Analyzer.

• Software: SeqA 7 (análisis de secuencias), SeqScape 4 (comparación de secuencias con librerías, por ejemplo, alelos HLA o cepas de patógenos), VariantReporter 3.0 (comparación de secuencias y análisis de mutaciones) y GeneMapper 6 (análisis de fragmentos y genotipado).

Mediante la plataforma GeneChip ponemos a disposición de los usuarios el equipamiento necesario para la hibridación, tinción y escaneado de los arrays de expresión y ofrecemos soporte y asesoramiento técnico a aquellos usuarios que lo demanden.

La plataforma incluye el siguiente equipamiento y softwares:

• GeneChip® Hybridization Oven 645

• GeneChip® Fluidics Station 450

• GeneChip® Scanner.

• Software: GeneChip® Command Console® Software, Expression Console® Software y Affymetrix® Transcriptome Analysis Console (TAC) Software.

El sistema MiSeq aprovecha el proceso químico de secuenciación por síntesis (SBS, sequencing by synthesis) de Illumina, una tecnología de secuenciación de nueva generación (NGS, next-generation sequencing) que integra la generación de grupos, la secuenciación y el análisis de datos en un solo instrumento.

El equipo Miseq permite la secuenciación masiva y en paralelo de millones de fragmentos de ADN mediante la tecnología de secuenciación por síntesis (SBS) desarrollada por Illumina. Dicho equipo puede generar hasta 25 M (M= millones) de lecturas en single-end por lo que es adecuado para la secuenciación de paneles pequeños de genes, amplicones, small RNAs, genomas pequeños y estudios de metagenómica (16S, ITS..)

El sistema de secuenciación NextSeq™ 1000 de Illumina ofrece un método selectivo de la secuenciación de nueva generación. Dicha plataforma integra la tecnología bioinformática DRAGEN (Análisis de lectura dinámica para GENómica, por sus siglas en inglés) y Bio-IT que ofrece una solución ultrarrápida y precisa para realizar análisis secundarios.

El equipo Nextseq 1000 es un secuenciador de nueva generación basado en una optimización de la tecnología SBS desarrollada por Illumina. Dicho equipo es capaz de generar hasta 400 M de lecturas lo que lo hace un equipo versátil que permite entre otras aplicaciones la secuenciación de un exoma completo, estudios de metagenómica shotgun, secuenciación de mRNA o totalRNA y secuenciación de célula única (3´gene expresión, scATAC-seq…). Esta plataforma también ofrece una solución rápida y precisa para analizar resultados a través de la plataforma integrada DRAGEN^TMBioIT

Mediante la plataforma 10x Genomics ponemos a disposición de los usuarios el equipamiento necesario que permite el aislamiento de células o núcleos de forma individualizada en las que se incluyen los reactivos necesarios para añadir marcas nucleotídicas especificas al transcriptoma o al genoma de cada célula.

La plataforma incluye el siguiente equipamiento y softwares:

• Chromium X

• Software Cellranger que proporciona pipelines de análisis para la secuenciación y para las distintas aplicaciones del sistema de aislamiento de célula única.

• Software Loupe Browser para la visualización de resultados.

El epMotion 5075 NGS solution combina el manejo automatizado de líquidos y características únicas de software con los accesorios y consumibles de alta calidad para una preparación fiable en librerías de NGS de hasta 96 muestras a la vez.

Además, es un equipo perfecto para cualquier aplicación de rutina, como la preparación de la PCR y la qPCR, diluciones en serie, distribuciones de reactivo, transferencias de muestras de tubos a placas y normalización de muestras.

Sistema de aislamiento de ácidos nucleicos para la selección de fragmentos de forma automatizada con alta recuperación y reproducibilidad.

Ideal para preparación de librerías de NGS y el aislamiento de miRNAs. Además, incorpora la opción de electroforesis en campo pulsado para la separación de proteínas a partir de muestras complejas para el estudio de biomarcadores y modificación de proteínas.

El equipo 4200 TapeStation es un sistema revolucionario para llevar a cabo electroforesis capilar en chips de un número variable de muestras (entre 1 y 96) para el control de calidad de ADN y ARN.

Entre sus aplicaciones también se encuentran el control de calidad de ADN genómico (ADNg) procedente de numerosas fuentes (como tejidos incluidos en parafina y fijados con formol), ADN extracelular (incluida la pureza en % de ADN extracelular), genotecas de NGS y genotecas amplificadas.

Lector de placas Multimodal de alta sensibilidad, máxima flexibilidad e intuitivo uso con 3 módulos independientes dedicados para detección de lecturas de intensidad de Fluorescencia, Absorbancia UV-Visible y Luminiscencia. Incluye BRET y FRET, y luminiscencia filtrada.

Dicho equipo tiene protocolos disponibles para cuantificación de ácidos nucleicos, análisis de interacción de proteínas, ensayos de cinasa y señalización celular, ensayos de multiplexación, ensayos basados ​​en células, ensayos de genes informadores, bioensayos o ELISA